1回の実験で1000万個の細胞と1000個以上の検体処理能力を実証
シアトル--(BUSINESS WIRE)--（ビジネスワイヤ） --アクセスしやすくスケーラブルなシングルセル シーケンシング ソリューションの大手プロバイダーであるパース・バイオサイエンシズは、シングルセル シーケンシングを年間数十億個の細胞に拡張するParse GigaLab™の立ち上げを発表しました。GigaLabは、スケールアップされたワークフローと拡張自動化機能を備えたパースのEvercode™シングルセル テクノロジーを活用し、従来のシングルセル アプローチでは不可能と思われていた発見を可能にします。
GigaLabは、1000万個以上の細胞を対象とするプロジェクトに取り組む研究者向けに構築されました。現在の処理能力では、年間25億個の細胞のプロファイリングが可能で、今後も急速に増える予定です。GigaLabで処理されているいくつかの初期プロジェクトは、すでに、現在までに公開されているすべてのシングルセル データセットで利用可能な細胞総数を超えると予想されています。これらの新たな機能は特に、大規模な薬剤および摂動スクリーニング、生成AIモデル用のデータセット生成、および集団研究用のアトラス作成に重点を置く研究者に役立ちます。
ウルトラハイスループットの画期的な次世代シーケンシング（NGS）プラットフォームの開発元であるアルティマ・ゲノミクスとの提携による最初のデモ、パースは1回の実行で1092サンプルを使用して、初となる細胞1000万個での実験を実施しました。バーコードとライブラリの準備はすべて合わせても3日しかかかりませんでした。この初の研究では、12人のPBMCドナーの18種類の免疫細胞にわたって90のサイトカイン変動を測定したところ、1万9000を超える変動が観察されました。パースのチームはアルティマとの提携に加え、ファビアン・タイス教授（ヘルムホルツ・ミュンヘン）とも提携しています。同教授の研究室は、シングルセル計算生物学ツールのScanpyを開発しました。タイス教授と彼の研究室は、この1000万個の細胞データセットを解析し、それを活用して新たなAIモデルのトレーニングを行っています。
タイス教授は、「大規模なシングルセル変動データセットは、健康と病気の両方で結果をより正確に予測するためのモデルを構築およびトレーニングに関して、まさにこの分野が求めているものです。パースがこれらのデータセットを提供できるスピードと規模は実に驚異的で、今後の発見のペースを加速させることでしょう」と述べています。
パース・バイオサイエンシズの最高技術責任者兼共同創設者であるチャーリー・ロコは、「パースの従来のキットを使用すると、研究者は1回の実験で100万個の細胞または核を日常的にプロファイリングできました。Evercodeテクノロジーの限界はまだ見つかっておらず、Parse GigaLabにより、シングルセル解析の新しい時代が到来し、生物学的発見と人間の健康を改善する可能性を再定義するでしょう」と述べています。
パースのチームメンバーは、11月6日午後2時30分（現地時間）に開催されるアメリカ人類遺伝学会（ASHG）カンファレンスのCoLabシアター講演（シアター 1）でGigaLabの機能に関する詳細を発表し、残りのカンファレンス期間中もブース#703で紹介する予定です。
パース・バイオサイエンシズについて
パース・バイオサイエンシズは、人々の健康と科学研究の進歩を加速させることを使命として世界的に活動するライフサイエンス企業です。研究者が、今までにない規模と容易さでシングルセル・シーケンシングを行えるよう支援しています。その先駆的なアプローチが、がん治療、組織の修復、幹細胞治療、腎臓および肝臓疾患、脳の発達、免疫システムといった分野での画期的な発見を可能にしています。
パースは、共同設立者であるアレックス・ローゼンバーグとチャールズ・ロコがワシントン大学で開発した技術を活用し、1億ドルを超える資金を調達し、現在では世界中で2000社を超える顧客をかかえています。拡大を続ける同社の製品ポートフォリオには、Evercode™ Whole Transcriptome、Evercode™ TCR、Evercode™ BCR、Gene Select、データ解析ソリューションであるTrailmaker™などが含まれます。
パース・バイオサイエンシズは最近、シアトルの活気あるサウスレイクユニオン地区で拡張を行い、新本社と最先端の研究所を構えました。詳細情報については、 https://www.parsebiosciences.com/ をご覧ください。
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