イン・シトゥ・ハイブリダイゼーション(ISH)は、組織や細胞内の特定の核酸配列(DNAまたはRNA)を検出および特定する分子生物学的手法である。ISHでは、標的配列にハイブリダイズする標識された相補的プローブを使用し、顕微鏡下で可視化する。ISHは、遺伝子発現の研究、ウイルスや細菌感染の検出、染色体異常の特定など、医学研究、診断、遺伝学の分野で広く利用されている。その変種には、蛍光 in situ ハイブリダイゼーション(FISH)や発色 in situ ハイブリダイゼーション(CISH)などがあり、それぞれ異なる用途に特有の利点をもたらす。ISH は、細胞機能、疾患のメカニズム、遺伝性疾患の理解に不可欠である。