JR北海道は、8月と9月に計12日間、特急ニセコ号を運転する。
運行日は8月31日、9月1日・5日~11日・14日~16日の計12日間。札幌~函館間を1日1往復し、車両は3両編成の183系が充当される。指定席2両、自由席1両。途中停車駅は、手稲・小樽・余市・俱知安・ニセコ・昆布・黒松内・長万部・森・新函館北斗・五稜郭。
俱知安~ニセコ間では地元特産品の販売(上下とも)を行うほか、余市駅では(上りのみ)停車時間中にホームで買い物も楽しめる。また、ダイヤは新函館北斗駅での北海道新幹線との乗り継ぎが考慮されている。
札幌(07:57)~新函館北斗(13:18)~函館(13:40)
函館(13:58)~新函館北斗(14:20)~札幌(19:27)